Sau khi bị kết án, ban đầu Lâm thi án tại nhà tù Stanley sau này chuyển sang nhà tù Thạch Bích cho đến nay.[20] Lâm thuộc nhóm tội phạm "hạng A" làm việc trong xưởng của nhà tù, lãnh lương vài trăm HKD và hầu như không giao tiếp hay đề cập đến quá khứ.

Năm 2009, số thứ 1010 của tạp chí "Next Magazine" Hồng Kông đã đăng một bức ảnh trong tù của Lâm.[21] Lâm là người có kỷ luật, thường đọc sách báo về y học và tôn giáo và ghi chép lại; ngoài thành viên tình nguyện của những giáo hội Cơ đốc, Công giáo đến thăm; không có thành viên nào trong gia đình nào đến thăm hắn. Lâm là người thích Tử vi đẩu số, hắn được xem là chuyên gia về khoản bạn tù và nhân viên nhà tù cũng đến xin quẻ chỗ hắn ta.[22] Nam người mẫu Cố Chí Nha, người được Vinh Văn Úy -cháu gái nhà tài phiệt Vinh Chí Kiện- tài trợ, từng cho biết anh ta đã kết bạn với Lâm Quá Vân khi ở trong tù.[23]

Năm 2018, báo chí có thông tin về việc Lâm nộp đơn ân xá và được phê duyệt, thông tin khiến người dân Hồng Kông lo lắng. Cục Dịch vụ cải huấn sau đó xác nhận Lâm không có đơn xin ân xá nhưng Ủy ban xem xét hình phạt vẫn xem xét bản án của Lâm mỗi 5 năm một lần theo quy định. Vì một số thành viên của Ủy ban lo sợ Lâm sẽ tái phạm nếu ra ngoài nên việc xem xét bị hủy bỏ.[23]

Theo lời kể của khách mời trong tập 2455 của Internet Horror Online, một tù nhân đã nhìn thấy Lâm giết và mổ gián trong tù, sau đó đặt "kiệt tác" của mình vào hộp diêm.[24]